Trong vụ án này, Viện kiểm sát nhân dân tối cao (Vụ 3) đã ban hành cáo trạng truy tố 14 bị can về các tội: “Vi phạm quy định về đấu thầu gây hậu quả nghiêm trọng”, “Lợi dụng chức vụ, quyền hạn trong khi thi hành công vụ”, “Đưa hối lộ”, “Nhận hối lộ” quy định tại khoản 3 Điều 222, khoản 3 Điều 356, khoản 4 Điều 364, khoản 4 Điều 354 - Bộ luật Hình sự năm 2015, sửa đổi bổ sung năm 2017.

Trong đó, Viện Kiểm sát truy tố Nguyễn Thị Thanh Nhàn, cựu Chủ tịch Công ty AIC; Trần Mạnh Hà, cựu Phó Tổng giám đốc AIC, về các tội “Đưa hối lộ”, “Vi phạm quy định về đấu thầu gây hậu quả nghiêm trọng”. Bị can Dương Hoa Xô, cựu giám đốc Trung tâm Công nghệ sinh học bị cáo buộc có hành vi “Nhận hối lộ”.

Các bị can Trần Thị Bình Minh, cựu phó giám đốc Sở Kế hoạch - Đầu tư Thành phố Hồ Chí Minh, và thuộc cấp là Phan Tất Thắng bị truy tố tội “Lợi dụng chức vụ, quyền hạn trong khi thi hành công vụ”.

Theo nội dung cáo trạng, năm 2014, Trung tâm Công nghệ sinh học Thành phố Hồ Chí Minh được phê duyệt kế hoạch chọn nhà thầu cung cấp thiết bị dự án với giai đoạn 1 trị giá 149 tỷ đồng, giai đoạn 2 trị giá khoảng 200 tỷ đồng và giai đoạn 3 trị giá hơn 75 tỷ đồng.

Biết Trung tâm Công nghệ sinh học Thành phố Hồ Chí Minh đang triển khai dự án 12 phòng thí nghiệm, cựu Chủ tịch AIC Nguyễn Thị Thanh Nhàn tiếp cận, làm quen và đề nghị Dương Hoa Xô, Giám đốc Trung tâm Công nghệ sinh học cho Công ty AIC tham gia, tạo điều kiện để doanh nghiệp này trúng thầu và xây dựng mức giá để AIC hưởng lợi 40% giá trị gói thầu.

Đề nghị của bị can Nhàn đã được bị can Xô đồng ý. Quá trình thực hiện, các bị can thông đồng với Công ty Tư vấn Hồng Hà và công ty khác do AIC chỉ định, lập hồ sơ mời thầu theo hướng có lợi cho Công ty AIC. Nhờ đó, Công ty AIC và Công ty Mopha (thuộc hệ sinh thái AIC) đã trúng 6 gói thầu, còn các công ty do AIC chỉ định gồm Công ty Gene Việt, Công ty Việt Á, Công ty Vimedimex trúng 3 gói thầu. Kết quả đấu thầu, Công ty AIC và các công ty được Công ty AIC chỉ định đứng tên thay cho Công ty AIC trúng 6 gói thầu, tổng trị giá 305.4 tỷ đồng; gây thiệt hại 83.1 tỷ đồng.

Cũng theo cáo buộc, sau khi được tạo điều kiện để trúng thầu, bị can Trần Thị Bình Minh được phía Công ty AIC gửi quà với số tiền 900 triệu đồng. Còn Dương Hoa Xô nhận quà với tổng số tiền hơn 14 tỷ đồng.

Để Công ty AIC trúng thầu còn có sự giúp sức với vai trò khác nhau của các bị can thuộc Công ty AIC và các Công ty có liên quan; bên cạnh đó là hành vi tạo điều kiện của các bị can thuộc Chủ đầu tư, làm trái quy định về quản lý nhà nước của các bị can thuộc cơ quan quản lý Nhà nước trong quá trình thực hiện Kế hoạch đấu thầu.